Vybavení servisní laboratoře Buněčného zobrazování - CELLIM na brněnském CEITECu se rozšířilo o plnou verzi softwaru Imaris – Single Full pro 3D vizualizace a analýzu obrazových dat z mikroskopu. Pro uživatele mikroskopů je to rozšíření dosavadních možností analýzy obrazových dat v široké škále oblastí od buněčné biologie, přes embryologii až po neurologii a tkáňový výzkum. Licence je provozována na dedikované pracovní stanici Mac Pro s parametry přizpůsobenými analýze a vizualizace objemných dat.
Popis nového zařízení:
Plná licence softwaru Imaris – Single Full sestává z těchto modulů:
- Core – 3D/4D vizualizace, Snapshots, Videa
- MeasurementPro - Statistické údaje, Měření tvarů a intenzity ve 3D/4D, Interaktivní uspořádání a klasifikace
- Vantage - Grafické zobrazení dat – 1D/2D/3D/4D, Srovnání dvou a více skupin dat, Statistické výpočty, rozpoznání trendů a odchylek
- Batch - vytvoření univerzálního protokolu pro hromadnou analýzu, Aplikace protokolu na různé obrazové datové sady zároveň, Možnost srovnání statistických údajů v modulu Vantage
- Coloc - Míra kolokalizace, Výběr různých kolokalizačních metod, Analýza ve 3D/4D
- XT - Kompatibilita s Matlab/Java/Python, Veřejná internetová platforma pro sdílení uživatelských rozšíření – Imaris Open
- Cell - Vztahy mezi buňkami a jejich organelami, Měření mechanických a strukturálních buněčných funkcí, Intuitivní jednotky na bázi buněčné morfologie (jádra, vezikuly, membrány)
- TrackLineage - Trasování objektů 2D/3D/4D (3D tracking), Automatická detekce buněčného dělení, Stopování buněčných linií
- FilamentTracer - Detekce a sledování filamentárních struktur (dendrity, cytoskelet, kanalikuly,...), Algoritmy pro automatickou analýzu, Možnost manuálního zpracování či manuální finální úpravy
Komponenty:
- Pracovní stanice Mac Pro
- Licence Imaris Single Full
- procesor: 2.7 GHz 12 core Intel Xeon E5
- paměť: 64 GB DDR3 RAM
- grafická karta: AMD FirePro D7000 6 GB
- OS: MacOS High Sierra
