Kolokalizace (colocalization), neboli vzájemný výskyt signálu ve dvojici obrazů. Analýza kolokalizace je zaměřená na posouzení toho, do jaké míry se vyskytuje signál, který byl vyvolaný objekty zájmu ve dvojici obrazů, na stejné pozici a ve stejné intenzitě. Stupeň kolokalizace v obraze lze vyčíslit hodnotou koeficientu, tzv. kolokalizační mírou. Nejvýznamnějšími koeficienty jsou:

  1. Koeficient korelace – tzv. Pearsonův korelační koeficient

  2. Míra překryvu (Overlap coefficient)

  3. Mandersonovy koeficienty

Vyhodnocením kolokalizace pomocí koeficientů dochází k velké redukci objemu dat – ze dvou obrazů s rozměry obvykle stovky až tisíce pixelů je výsledkem jedno nebo dvě čísla vystihující závislost vzájemného výskytu informace v obou obrazech.